A Santa Casa da Misericórdia de Alpalhão tem como Entidades Parceiras:
- Câmara Municipal de Nisa;
- Junta de Freguesia de Alpalhão;
- União das Misericórdias Portuguesas;
- Diocese de Portalegre – Castelo Branco;
- Paróquia de Nossa Senhora da Graça de Alpalhão;
- Centro Distrital de Segurança Social de Portalegre;
- Instituto de Emprego e Formação Profissional;
- Misericórdias do Distrito de Portalegre – Secretariado Regional;
- Instituto Politécnico de Portalegre;
- Agrupamento de Escolas de Nisa;
- Movimento Teresiano do Apostolado;
- Entre outros.